Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX9Q08211 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX9Q08211 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms