Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXM1Q08050 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXM1Q08050 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXM1Q08050 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms