Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL16A1Q07092 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
COL16A1Q07092 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL16A1Q07092 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL16A1Q07092 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms