Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCDQ05655 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKCDQ05655 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms