Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF11Q05519 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms