Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD164Q04900 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD164Q04900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD164Q04900 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD164Q04900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD164Q04900 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CD164Q04900 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD164Q04900 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CD164Q04900 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD164Q04900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CD164Q04900 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CD164Q04900 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CD164Q04900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD164Q04900 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms