Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN1Q04323 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN1Q04323 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms