Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFHR1Q03591 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFHR1Q03591 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms