Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFF2Q03403 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFF2Q03403 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFF2Q03403 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms