Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NHLH2Q02577 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLH2Q02577 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLH2Q02577 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms