Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHLH1Q02575 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLH1Q02575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms