Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MC1RQ01726 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms