Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TFAP4Q01664 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFAP4Q01664 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFAP4Q01664 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP4Q01664 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms