Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC7A5Q01650 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC7A5Q01650 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC7A5Q01650 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC7A5Q01650 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC7A5Q01650 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms