Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK6Q00534 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK6Q00534 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms