Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC5Q00444 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms