Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX4P78413 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX4P78413 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX4P78413 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX4P78413 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX4P78413 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX4P78413 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX4P78413 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX4P78413 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX4P78413 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX4P78413 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX4P78413 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX4P78413 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX4P78413 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX4P78413 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX4P78413 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX4P78413 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX4P78413 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX4P78413 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX4P78413 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX4P78413 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX4P78413 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX4P78413 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX4P78413 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX4P78413 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX4P78413 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX4P78413 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX4P78413 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms