Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT85P78386 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT85P78386 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT85P78386 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT85P78386 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT85P78386 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT85P78386 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT85P78386 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT85P78386 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT85P78386 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT85P78386 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT85P78386 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT85P78386 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT85P78386 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT85P78386 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT85P78386 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT85P78386 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT85P78386 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT85P78386 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT85P78386 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT85P78386 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT85P78386 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT85P78386 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT85P78386 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms