Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT83P78385 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT83P78385 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT83P78385 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT83P78385 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT83P78385 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT83P78385 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT83P78385 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT83P78385 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT83P78385 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT83P78385 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT83P78385 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT83P78385 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT83P78385 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT83P78385 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT83P78385 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT83P78385 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT83P78385 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT83P78385 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT83P78385 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT83P78385 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT83P78385 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT83P78385 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT83P78385 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT83P78385 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT83P78385 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT83P78385 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT83P78385 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT83P78385 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT83P78385 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT83P78385 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT83P78385 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT83P78385 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms