Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC5P78333 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPC5P78333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC5P78333 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC5P78333 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC5P78333 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC5P78333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC5P78333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC5P78333 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC5P78333 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC5P78333 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC5P78333 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC5P78333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC5P78333 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC5P78333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC5P78333 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC5P78333 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC5P78333 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC5P78333 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC5P78333 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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