Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTG1P63261 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTG1P63261 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTG1P63261 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTG1P63261 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACTG1P63261 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG1P63261 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms