Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPD1P62314 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRPD1P62314 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPD1P62314 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms