Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P61574 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms