Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1BP61266 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1BP61266 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX1BP61266 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX1BP61266 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX1BP61266 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1BP61266 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1BP61266 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1BP61266 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1BP61266 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1BP61266 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1BP61266 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1BP61266 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1BP61266 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1BP61266 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1BP61266 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1BP61266 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1BP61266 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1BP61266 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX1BP61266 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX1BP61266 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1BP61266 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1BP61266 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX1BP61266 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms