Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS3AP61247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS3AP61247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS3AP61247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms