Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX4P57082 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX4P57082 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX4P57082 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX4P57082 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX4P57082 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX4P57082 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX4P57082 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX4P57082 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX4P57082 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX4P57082 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX4P57082 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX4P57082 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX4P57082 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX4P57082 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TBX4P57082 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX4P57082 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX4P57082 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX4P57082 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX4P57082 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX4P57082 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX4P57082 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX4P57082 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX4P57082 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBX4P57082 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX4P57082 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX4P57082 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX4P57082 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX4P57082 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX4P57082 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX4P57082 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX4P57082 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX4P57082 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX4P57082 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms