Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN8P56748 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms