Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARL4CP56559 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL4CP56559 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL4CP56559 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms