Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELLP55199 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELLP55199 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELLP55199 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELLP55199 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELLP55199 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELLP55199 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELLP55199 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELLP55199 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELLP55199 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELLP55199 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELLP55199 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELLP55199 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELLP55199 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELLP55199 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELLP55199 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELLP55199 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ELLP55199 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELLP55199 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELLP55199 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ELLP55199 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELLP55199 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELLP55199 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELLP55199 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ELLP55199 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ELLP55199 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ELLP55199 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms