Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF10P55107 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF10P55107 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF10P55107 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF10P55107 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF10P55107 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF10P55107 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF10P55107 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF10P55107 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF10P55107 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF10P55107 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF10P55107 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF10P55107 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF10P55107 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF10P55107 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF10P55107 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF10P55107 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF10P55107 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF10P55107 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF10P55107 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF10P55107 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF10P55107 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms