Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB1P54762 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB1P54762 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB1P54762 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms