Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVDP53602 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MVDP53602 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVDP53602 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVDP53602 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVDP53602 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MVDP53602 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MVDP53602 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MVDP53602 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MVDP53602 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MVDP53602 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MVDP53602 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MVDP53602 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MVDP53602 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MVDP53602 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MVDP53602 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MVDP53602 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MVDP53602 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MVDP53602 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms