Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUBP1P53384 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUBP1P53384 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms