Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LBX1P52954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LBX1P52954 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LBX1P52954 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LBX1P52954 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LBX1P52954 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LBX1P52954 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LBX1P52954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LBX1P52954 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LBX1P52954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LBX1P52954 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LBX1P52954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LBX1P52954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LBX1P52954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LBX1P52954 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LBX1P52954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LBX1P52954 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LBX1P52954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LBX1P52954 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LBX1P52954 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LBX1P52954 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LBX1P52954 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LBX1P52954 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LBX1P52954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LBX1P52954 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LBX1P52954 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LBX1P52954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LBX1P52954 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LBX1P52954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LBX1P52954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LBX1P52954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LBX1P52954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LBX1P52954 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LBX1P52954 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LBX1P52954 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LBX1P52954 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LBX1P52954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LBX1P52954 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LBX1P52954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LBX1P52954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LBX1P52954 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LBX1P52954 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LBX1P52954 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LBX1P52954 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LBX1P52954 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LBX1P52954 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LBX1P52954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LBX1P52954 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LBX1P52954 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LBX1P52954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX1P52954 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX1P52954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LBX1P52954 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LBX1P52954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms