Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGDP52209 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGDP52209 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGDP52209 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGDP52209 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGDP52209 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGDP52209 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGDP52209 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGDP52209 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGDP52209 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGDP52209 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGDP52209 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGDP52209 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGDP52209 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGDP52209 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGDP52209 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGDP52209 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGDP52209 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGDP52209 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PGDP52209 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGDP52209 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGDP52209 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGDP52209 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGDP52209 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PGDP52209 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGDP52209 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGDP52209 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGDP52209 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGDP52209 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms