Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA3P51805 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA3P51805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNA3P51805 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA3P51805 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms