Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27AP51159 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms