Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP153P49790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP153P49790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP153P49790 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP153P49790 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP153P49790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP153P49790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP153P49790 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP153P49790 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NUP153P49790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NUP153P49790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NUP153P49790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NUP153P49790 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NUP153P49790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUP153P49790 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUP153P49790 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP153P49790 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP153P49790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP153P49790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP153P49790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUP153P49790 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUP153P49790 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUP153P49790 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUP153P49790 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUP153P49790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NUP153P49790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NUP153P49790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
NUP153P49790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUP153P49790 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUP153P49790 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUP153P49790 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUP153P49790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUP153P49790 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUP153P49790 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUP153P49790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUP153P49790 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NUP153P49790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NUP153P49790 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUP153P49790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUP153P49790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUP153P49790 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUP153P49790 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUP153P49790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUP153P49790 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NUP153P49790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUP153P49790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NUP153P49790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NUP153P49790 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NUP153P49790 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUP153P49790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUP153P49790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUP153P49790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUP153P49790 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUP153P49790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP153P49790 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP153P49790 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms