Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARRES1P49788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARRES1P49788 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARRES1P49788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms