Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLK2P49760 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLK2P49760 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLK2P49760 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLK2P49760 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLK2P49760 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLK2P49760 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLK2P49760 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLK2P49760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLK2P49760 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLK2P49760 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLK2P49760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLK2P49760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLK2P49760 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLK2P49760 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLK2P49760 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLK2P49760 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLK2P49760 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLK2P49760 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLK2P49760 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLK2P49760 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLK2P49760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK2P49760 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK2P49760 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK2P49760 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK2P49760 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLK2P49760 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLK2P49760 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLK2P49760 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLK2P49760 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLK2P49760 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLK2P49760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLK2P49760 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLK2P49760 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLK2P49760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLK2P49760 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK2P49760 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK2P49760 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK2P49760 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK2P49760 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLK2P49760 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLK2P49760 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLK2P49760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLK2P49760 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLK2P49760 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms