Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC1P48547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC1P48547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms