Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GCLCP48506 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCLCP48506 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCLCP48506 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCLCP48506 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCLCP48506 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GCLCP48506 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCLCP48506 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCLCP48506 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCLCP48506 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCLCP48506 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCLCP48506 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCLCP48506 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCLCP48506 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCLCP48506 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCLCP48506 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCLCP48506 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCLCP48506 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCLCP48506 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCLCP48506 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCLCP48506 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCLCP48506 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCLCP48506 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCLCP48506 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCLCP48506 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCLCP48506 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCLCP48506 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCLCP48506 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCLCP48506 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCLCP48506 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GCLCP48506 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCLCP48506 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GCLCP48506 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GCLCP48506 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCLCP48506 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCLCP48506 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCLCP48506 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCLCP48506 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCLCP48506 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCLCP48506 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCLCP48506 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCLCP48506 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCLCP48506 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCLCP48506 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCLCP48506 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GCLCP48506 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCLCP48506 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCLCP48506 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCLCP48506 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms