Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIA4P48058 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIA4P48058 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms