Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNJ1P48048 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNJ1P48048 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNJ1P48048 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNJ1P48048 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNJ1P48048 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms