Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQLP46063 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQLP46063 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQLP46063 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQLP46063 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQLP46063 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQLP46063 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQLP46063 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQLP46063 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQLP46063 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQLP46063 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQLP46063 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQLP46063 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQLP46063 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQLP46063 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQLP46063 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RECQLP46063 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RECQLP46063 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RECQLP46063 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RECQLP46063 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RECQLP46063 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RECQLP46063 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RECQLP46063 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RECQLP46063 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RECQLP46063 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RECQLP46063 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RECQLP46063 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RECQLP46063 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RECQLP46063 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms