Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA1P43355 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA1P43355 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 486.8 ms