Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMPOP42166 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMPOP42166 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMPOP42166 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMPOP42166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TMPOP42166 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMPOP42166 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMPOP42166 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMPOP42166 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMPOP42166 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMPOP42166 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMPOP42166 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMPOP42166 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMPOP42166 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMPOP42166 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMPOP42166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
TMPOP42166 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMPOP42166 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMPOP42166 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMPOP42166 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMPOP42166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMPOP42166 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMPOP42166 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMPOP42166 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMPOP42166 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMPOP42166 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMPOP42166 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMPOP42166 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMPOP42166 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMPOP42166 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMPOP42166 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMPOP42166 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMPOP42166 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMPOP42166 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMPOP42166 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMPOP42166 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMPOP42166 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMPOP42166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TMPOP42166 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMPOP42166 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMPOP42166 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMPOP42166 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMPOP42166 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMPOP42166 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMPOP42166 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMPOP42166 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TMPOP42166 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMPOP42166 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMPOP42166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TMPOP42166 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMPOP42166 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms