Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDH1P40925 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDH1P40925 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MDH1P40925 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDH1P40925 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDH1P40925 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDH1P40925 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDH1P40925 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDH1P40925 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDH1P40925 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDH1P40925 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDH1P40925 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MDH1P40925 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDH1P40925 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDH1P40925 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDH1P40925 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MDH1P40925 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDH1P40925 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDH1P40925 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDH1P40925 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDH1P40925 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDH1P40925 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDH1P40925 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDH1P40925 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDH1P40925 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDH1P40925 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDH1P40925 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDH1P40925 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDH1P40925 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDH1P40925 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDH1P40925 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDH1P40925 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDH1P40925 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDH1P40925 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDH1P40925 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDH1P40925 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDH1P40925 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDH1P40925 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDH1P40925 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms