Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP8P40818 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP8P40818 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP8P40818 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP8P40818 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP8P40818 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP8P40818 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP8P40818 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP8P40818 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP8P40818 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP8P40818 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP8P40818 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP8P40818 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP8P40818 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP8P40818 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
USP8P40818 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP8P40818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP8P40818 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP8P40818 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP8P40818 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP8P40818 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP8P40818 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP8P40818 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP8P40818 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP8P40818 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP8P40818 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP8P40818 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP8P40818 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms