Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPGP40121 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPGP40121 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPGP40121 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPGP40121 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPGP40121 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPGP40121 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPGP40121 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPGP40121 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPGP40121 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPGP40121 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPGP40121 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPGP40121 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPGP40121 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPGP40121 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPGP40121 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPGP40121 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPGP40121 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPGP40121 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPGP40121 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPGP40121 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPGP40121 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms